病理科是广元地区病理质控中心挂靠单位、广元市重点专科。目前工作人员8名，其中高级职称3名，研究生学历3人。病理学是应用病理学知识和方法对临床送检的活体组织、细胞进行检查，结合临床资料最后作出病理诊断。

科室开展常规项目：手术切除的各种标本、各种内窥镜（胃镜、肠镜、支气管镜等）活检标本进行病理诊断；术中冷冻切片快速病理诊断；细胞学诊断包括胸水、腹水、痰涂片、支气管刷片以及宫颈液基细胞学等；尸体解剖及诊断；全自动免疫组化、特殊染色等。科室近期开展的新技术项目：FISH荧光原位杂交技术、HPVE6/E7mRNA检测以及肿瘤微卫星不稳定性检测；科室分子病理室正在积极建设中。年病例量组织学活检12000余例，冰冻1500余例，年疑难病理会诊300余例，免疫组化1000余例，特殊染色500余例，各类细胞学11000余例，分子病理检测5000余例。近期在权威医学杂志上共发表专业论文20余篇。科室拥有莱卡CM1950型恒冷切片机1台、莱卡2245型轮转式切片机2台；莱卡SP200型全自动脱水机1台；DAKO全自动免疫组化染色机1台，HOLOGIC全自动HPVE6/E7检测平台，科立达全自动HE染色机，原装进口OLYMPUS BX53显微镜2台、Nikon 50i显微镜3台、莱卡MD3000显微镜1台等先进的设备，LOGENE-1型病理图像分析系统，FISH分子检测平台1个。